Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms