Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms