Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms