Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KBTBD3Q8NAB2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KBTBD3Q8NAB2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms