Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M4

TTC9C, Tetratricopeptide repeat protein 9C, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9CQ8N5M4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9CQ8N5M4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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