Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HAPLN4Q86UW8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HAPLN4Q86UW8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms