Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms