Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM43BQ6ZT52 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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