Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms