Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms