Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms