Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3EQ6PEY2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms