Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms