Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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SAMD13Q5VXD3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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