Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QL3Q5VWW1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QL3Q5VWW1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms