Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms