Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms