Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q1T7F1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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