Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms