Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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