Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms