Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDSNQ15517 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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