Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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