Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIXQ14938 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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