Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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