Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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