Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOFQ13790 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
APOFQ13790 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
APOFQ13790 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
APOFQ13790 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOFQ13790 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOFQ13790 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOFQ13790 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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