Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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