Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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