Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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