Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms