Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms