Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms