Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP4Q07065 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms