Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARDQ03181 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARDQ03181 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms