Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms