Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms