Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX1P78337 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX1P78337 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms