Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB4BP68371 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB4BP68371 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms