Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOBP62745 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOBP62745 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOBP62745 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOBP62745 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms