Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms