Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB4P54760 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms