Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms