Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK4P51957 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK4P51957 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK4P51957 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK4P51957 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK4P51957 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK4P51957 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK4P51957 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK4P51957 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK4P51957 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK4P51957 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK4P51957 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK4P51957 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK4P51957 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK4P51957 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK4P51957 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK4P51957 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK4P51957 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK4P51957 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK4P51957 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK4P51957 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK4P51957 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK4P51957 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK4P51957 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK4P51957 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK4P51957 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK4P51957 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK4P51957 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK4P51957 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK4P51957 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK4P51957 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK4P51957 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK4P51957 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK4P51957 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK4P51957 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK4P51957 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK4P51957 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK4P51957 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK4P51957 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEK4P51957 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEK4P51957 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEK4P51957 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEK4P51957 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEK4P51957 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK4P51957 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK4P51957 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK4P51957 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK4P51957 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK4P51957 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK4P51957 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK4P51957 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK4P51957 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK4P51957 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK4P51957 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK4P51957 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK4P51957 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK4P51957 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK4P51957 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms