Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRXP46100 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRXP46100 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRXP46100 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATRXP46100 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRXP46100 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms