Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms