Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL3P36405 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL3P36405 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL3P36405 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL3P36405 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL3P36405 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL3P36405 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL3P36405 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL3P36405 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL3P36405 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL3P36405 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms