Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFC4P35249 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFC4P35249 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFC4P35249 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC4P35249 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC4P35249 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC4P35249 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC4P35249 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC4P35249 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC4P35249 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC4P35249 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC4P35249 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC4P35249 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC4P35249 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC4P35249 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC4P35249 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC4P35249 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC4P35249 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC4P35249 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC4P35249 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC4P35249 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC4P35249 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC4P35249 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC4P35249 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC4P35249 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC4P35249 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC4P35249 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC4P35249 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC4P35249 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC4P35249 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC4P35249 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC4P35249 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC4P35249 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC4P35249 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC4P35249 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC4P35249 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC4P35249 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC4P35249 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC4P35249 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC4P35249 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms