Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms