Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB4P28070 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms